Mykobakterien sind Bakterien der Familie Mycobacteriaceae mit der einzigen Gattung Mycobacterium, welche etwa 54 Arten umfasst. Aufgrund eines speziellen Zellwandaufbaus besitzen sie eine sehr hohe Widerstandsfähigkeit. Dies bewirkt, das Mykobakterien in der Natur unter günstigen Bedingungen mehrere Monate infektionsfähig bleiben und mit wenigen Ausnahmen (z.B. Streptomycin oder Kanamycin) gegen die meisten Antibiotika unempfindlich (resistent) sind.
Die typischen Mykobakterien verursachen beim Menschen Tuberkulose und Lepra. Als "sonstige Mykobakterien" beschreibt man hingegen solche Erreger, die sich diesem Formenkreis entziehen. Der Begriff "atypische" Mykobakterien ist hierfür nicht mehr gebräuchlich, daher verwendet man die Bezeichnung MOTT (Mykobacteria other than tuberculosis).